一、留学目的不清晰。
赴日读研更重要的是要对自己的实力进行自我评价，对自己的留学目的进行清楚的把握。如果仅仅是想体验一下日本的大学院生活，怀着可能的话拿一个学位这样的想法，而志不在做学问，也自感没有多大能力做学问做研究，那最好是申请适合自己实际情况的学校，否则即使申请成功，赴日后将会增加自己的负担，甚至连自己起码的目标都达不到。
因为越是一流的大学，对学生的要求就越高。如果你没有水平，首先影响到导师对你的看法，你可能不能从研究生考入大学院;其次，即使侥幸考上，你的日子也不好过，你可能跟不上课程，做不了实验，写不出研究报告、毕业论文，进而影响到日常生活。
一、赴日读研简单化。
不少同学会误认为赴日读研就是提供申请材料，申请在留资格和签证，其实不然。日本的语言学校大多由公司经营，以赢利为目的，计划招生人数很多，通常在100-300名左右，达到一定学生规模方能维持，所以对申请者的要求相对较低，只要在年龄、学历、经费支付等方面符合日本入国管理局的标准，统统可以录取，至于毕业后是否能考上大学不是语言学校关心的事情。
因此，读语言学重在申请。而日本的大学院(研究生)招收的是高层次的研究人才，其最基本的标准是考查申请者是不是有进入大学院的知识水平和研究能力，招生人数有限。由于国内教育观念、研究训练方法的限制，对日本的教育制度研究方法缺乏了解，以及中日在教育研究方法、思维方式上的差异，国内的大学生在研究课题选择和研究计划书作成等方面往往无从下手，即使能够赴日，在修士(硕士)博士进学考试以及其后的学习和研究中也困难重重。这就需要谙熟中日教育状况，研究思维方式的学者进行专业的指导培训。
二、挑选学校局限化。
不少同学以某地区某学校有亲戚、同学、朋友或打工是否方便、城市是否繁荣为由，甚至以气候等原因挑选地区、学校。这明显是受语言学校的影响。日本的语言学校数量很多，每个城市都有数所，希望申请者多多益善，如果不考虑拒签率，申请者可随便选择地区学校。需要说明的是，在日生活学习过的人都知道，亲戚、同学、朋友的照顾是十分有限的;打工主要取决于语言程度而不是地区;日本的国立大学都在县厅(省府)所在地，除几个特大城市外，其他县厅(省府)所在地城市差别不大。这且不说，如果以这些理由选择地区和学校，将会大大降低申请的成功率。
降低申请成功率的原因如下：
1、大多数县只有一所国立大学。
日本的国立大学总共有97所，除去专业性的大学，绝大多数地方(县)只有一所国立大学，如果是挑选某个地区，在大多数情况下实际上意味着只能申请一所大学。另外，有些大学招收研究生有严格的限制，如只接受公费留学生，或与之有学术交流协定、学生交换协定大学的学生等。
2、绝大多数日本大学研究生的录取采取指导教授决定制。
教授接受申请者的最基本前提是其所研究的专业课题必须与教授一致。不论在哪个国家，研究同一课题的导师都是有限的，在同一所大学里研究同一课题的导师就更少了。另外，即使成功地对上了导师的研究课题，但导师接受的研究生是有限的，一般只带一、两个人，名额已满的情况很多，导师出国讲学不便接受研究生的情况也不少。这些因素就决定了导师联系的方式——这个不行联系另一个，也就是说只能是以专业课题来联系导师，从而确定学校，确定地区，而不是相反，更不是以其他因素来确定，否则申请渺茫。
4、不符合教授要求。
教授是否接受申请者的因素主要有：
①申请者的基本条件象学历、语言水平;
②基础学力即知识水平和研究能力;
③培养潜力。
后两项主要是通过成绩表、研究业绩、论文、作品以及研究课题的确定、研究计划书的写作来判定。除次之外，还要看毕业学校的档次，一般情况下，毕业学校档次应与所申请的学校的档次相当，如果差的太多将会影响申请。
