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根据《教育部关于公布2012年度普通高等学校本科专业设置备案或审批结果的通知》，此次经教育部备案的专业一共2670个，其中包括53个经教育部审批同意的国家控制布点的专业和7个经教育部审批同意设置的新专业，除需考察的四个医学类专业，新增专业可自今年开始招生。需考察的4个医学类专业待考察合格后方可招生。合肥工业大学此次通过审核批准的本科专业6个，今年可招生。其专业名称、专业代码、修业年限、学位授予门类等以公布内容为准。
| 号 | 主管部门、学校名称 | 专业代码 | 专业名称 | 修业年限 | 学位授予门类 | 备注 |
| 教育部 | ||||||
| 96 | 合肥工业大学 | 020302 | 金融工程 | 四年 | 经济学 | |
| 97 | 合肥工业大学 | 080201 | 机械工程 | 四年 | 工学 | |
| 98 | 合肥工业大学 | 080602T | 智能电网信息工程 | 四年 | 工学 | |
| 99 | 合肥工业大学 | 080710T | 集成电路设计与集成系统 | 四年 | 工学 | |
| 100 | 合肥工业大学 | 081102 | 水文与水资源工程 | 四年 | 工学 | |
| 101 | 合肥工业大学 | 081304T | 能源化学工程 | 四年 | 工学 | |
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