东京理科大学的前身是东京物理学校，是由21名理工科物理系毕业生在1881年创建的。东京理科大学拥有128年的历史，其前身为1881年成立的东京物理学讲习所，1883年改称东京物理学校，1949年更改为现在的校名。现今，东京理科大学拥有8个学部、10个大学院研究科，并开设了夜间学部课程以及供社会人士进修的专攻科课程，这在私立大学中是很少见的。
东京理科大学有四个校区，分别是神乐坂校区、野田校区、久喜校区和长万部校区。神乐坂校区位于东京都，设有神乐坂和九段两个校园，是理学部第一部、理学部第二部、工学部第一部、工学部第一部和理学专攻科所在地;野田校区位于千叶县，那里有药学部、理工学部和基础工学部二年级以上的学生;久喜校区位于琦玉县，经营学部设在这里;长万部校区位于北海道，基础工业学部一年级的学生在这里学习。
本科课程设置
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理学部第一部
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数学科、数理信息科学科、物理学科、应用物理学科、化学科、应用化学科
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工学部第一部
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建筑学科、工业化学科、电气工学科、经营工学科、机械工学科
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药学部
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药学科、药学生命科学科
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理工学部
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数学科、物理学科、信息科学科、应用生物科学科、建筑学科、理论及应用化学科、电气工学科、工业管理学科、机械工学科、土木工学科
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基础工学部
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电子应用工学科、材料工学科、生物工学科
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经营学部
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经营学科
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理学部第二部
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数学科、物理学科、化学科
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工学部第二部
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建筑学科、电气工学科、经营工学科
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研究科课程设置
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理学研究科
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数学、物理学、应用物理学、数理信息科学
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工学研究科
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建筑学科、工业化学科、电气工学科、经营工学科、机械工学科
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综合化学研究科
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综合化学
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科学教育研究科
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科学教育
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药学研究科
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药学
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理工研究科
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数学、物理学、信息科学、应用生物科学、建筑学、理论及应用化学、电气工学、经营工学、机械工学、土木工学
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基础工学研究科
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电子应用工学、材料工学、生物工学
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经营学研究科
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经营学
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生命科学研究科
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生命科学
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综合科学技术经营研究科
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综合科学技术经营(MOT)、知识产权战略(MIP)。注：该研究科为专门职学位课程。
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