这项调查的实施对象是日本全国86所国立大学和学生人数超过1万人的43所私立大学，今年是第二次实施。调查将国立大学和私立大学分开进行对比。国立大学方面，受日本政府投入资金减少影响，86所大学2013年度的合计收入为291亿日元，与前一年度相比减少一成。其中东京大学以49亿日元的收入连续2年位居日本国立大学之首，这一收入额度与前一年度相比增加9%。附属医院收入增加以及来自企业和政府的研究经费的增加是东京大学收入增加的主要原因。
国立大学中收入排在第二至第六位的分别是大阪大学、东北大学、东京医科齿科大学、名古屋大学和京都大学。不少学校学费收入持续减少，附属医院成为左右学校收入的关键，大阪大学、东北大学和京都大学附属医院的收入均有增加。
私立大学方面，受学生人数减少导致学费收入减少影响，2013年合计收入与前一年度相比也有减少，减幅约为一成。但是受专业调整措施效果影响，帝京大学2013年收入大幅增至169亿日元，成为日本收入最高的大学。排在第二至第五位的分别是近畿大学、帝京平成大学、早稻田大学、立正大学。