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中山大学药学院是原中山大学和中山医科大学两校合并后于2002年6月成立的第一个新学院。学院以中山大学生命科学学院药学系为基础，整合了中山大学生命科学学院、化学与化学工程学院以及医学院有关药学科学研究的资源，以中山大学的综合力量为依托组建而成。现任院长为黄民教授。
药学院自成立以来，坚持以高标准、高起点要求自身。着名中国科学院院士陈新滋教授担任药学院名誉院长，他对未来的定位提出了明确的目标：“用五到十年的时间，成为中国一流的药学院”。为实现这一目标，学院一直致力于学科建设，积极引进各类教学和科研人才，加强各种硬件建设，不断完善各种规章制度，充分调动教职员工积极性，努力营造学院文化。现已在师资队伍建设、人才培养、科研和新药研发等方面取得了显着成绩。学院现有教职工85人，其中教师59名，实验技术人员17人，行政人员9人。教师中教授21人，副教授21人，讲师15人，助教2人。博士生导师20人，硕士生导师41人。师资队伍中有4人入选教育部新世纪优秀人才支持计划，先后有13人被列为“广东省千百十工程”培养对象；黄志纾教授先后获“广东省南粤优秀教师”、第十届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛“优秀指导教师”、第九届“挑战杯”广东大学生课外学术科技作品竞赛“优秀指导教师”光荣称号。
目前在读本科生487名，硕士研究生251名，博士研究生107名。本科生招生规模为每年120人，研究生招生规模呈稳步增长态势。
2006年1月，经教育部批准，中山大学成为目前华南地区高校中唯一获得药学一级学科博士学位授予权的学科，博士点覆盖了药理学、药物化学、生药学、药物分析、药剂学、微生物与生化药学等6个二级学科；2007年9月，药学院获国家人事部批准设立药学（一级学科）博士后科研流动站。
学院于2008年7月启用位于大学城的建筑面积为2.3万平方米的药学大楼，目前实验室使用面积达到1.2万平方米以上。学院非常重视实验室科研条件建设，现已购置了10万元以上用于药学科学研究的大型贵重仪器近70台，如核磁共振仪、质谱仪、X-单晶衍射仪、荧光光谱仪、凝胶成像仪、CO2超临界萃取仪、全自动生化仪、红外光谱仪、各种高效液相色谱仪、软胶囊机、流化床包衣机、挤出-滚圆造粒机等等。购置仪器3000多件，总价值达6800多万元。
学院的总体发展目标是，以创新药物研究为龙头，组建与国际接轨的公共技术平台。借助学校的整体力量，将药学院办成具有国内先进水平，某些领域在国际上有较大影响的科学研究与高层次人才培养基地，特别是培养创新药物的团队和人才。使药学院成为广东省和全国的药物（新药）研究、开发与评价中心及药学人才培养基地。
专业设置：
本科专业：药学
硕士点：有机化学、药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学、制药工程
博士点：有机化学、药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学
博士后流动站：药学（一级学科）博士后科研流动站
研究机构：
学院下设8个专业实验室，拥有III期985工程建设项目——华南新药创制科技创新平台。以药学院为申报单位获批：
“创新药物制剂工程中心”（广东省教育厅, 2009, 吴传斌）
“手性药物工程中心” （广东省教育厅, 2009, 鄢明）
“新药临床前药效学评价平台” （国家科技部, 2009, 刘培庆）
“新药临床前药代动力学评价平台” （国家科技部, 2009, 黄民）
“创新药物制剂工程技术研究中心” （广东省科技厅, 2010, 吴传斌）
“现代中药工程技术研究开发中心”（广东省科技厅, 2010, 杨得坡）
“新药设计与评价重点实验室”（广东省科技厅, 2011, 黄民）
“新药成药性评估及评价工程实验室”（广东省发改委, 2011, 刘培庆）
科研情况
药学院的科研工作坚持以创新药物的研究与开发为龙头，致力于加强新药创制体系及评价体系的建设，注重团队协作，积极推行PI负责人制，克服互不通气、各自为“研”的封闭式科研弊端，通过团队协作进行科研攻关，积极组织重大项目的实施及工程中心的建设。建院以来我院共承担纵向科研项目367项，横向项目471项，其中国家“重大新药创制”科技重大专项10余项，药学院作为主要方向负责单位还获得2项科技部国家支撑计划支持及1项973项目滚动支持，国家自然科学基金80项，获批经费2.5亿元，高级职称人均66.5万元；发表论文1200余篇，其中SCI收录560余篇，获得授权专利92项。
学术交流与合作
学院积极开展各项国际、国内学术交流及科研合作，推动学院的学科建设、人才培养及社会服务等工作。其中：
1. 短期专家交流讲学：2008年至今共邀请121名（其中外籍人士54人次，华裔67人次）相关领域知名专家来我院举行药学前沿大讲堂学术讲座。
2. 师生出访交流学习情况
2008年至今共派出11位青年教师出国进修和深造；
2010年以来共派出近20名硕士、博士研究生前往全球知名高校联合培养进修（1-2年）。
3.承担国际（境外）合作与交流项目25项。
4.主办或承办的国际学术会议：
2004年12月，举办“精细化工与药物合成国际研讨会”；
2009年10月，举办首届“国际工业药学与临床药学研讨会”；
2011年9月，承办“国际药物代谢学会(ISSX)暨中国药物和化学异物代谢专业委员会(CSSX)联合学术会议”；
2011年11月，承办“2011年全国药物化学学术会议暨第三届中英药物化学学术会议”。
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