波士顿大学不但拥有一流的师资、设备，也拥有健全的科系。全校共有十五个学院，例如艺术学院（School for the Arts）、大众传播学院（College of Communication）、教育学院（School of Education）、牙医学院（Gold man School of Graduate Dentistry）、工学院（College of Engineering）、法学院（School of Law）、文学院（College of Liberal Arts）、商学院（School of Management）、医学院（School of Medicine）、大都会学院（Metro politan College）、公共卫生学院（School of Public Health）、社会工作学院（School of Social Work）等，共包括两百五十个以上不同的科系，为一完整的综合大学。其中，大都会学院为波士顿大学的一大特色，专为社会人士提供在职进修的机会。
| 排名名称 | 名次 |
| 普林斯顿2010—康复及治疗专业 | 第1名 |
| 普林斯顿2010—修正法 | 第2名 |
| 普林斯顿2010—社会科学 | 第2名 |
| 普林斯顿2010—生物医学工程 | 第2名 |
| 普林斯顿 2010 —社会学 | 第3名 |
| Princeton 2010- Analytical Chemistry | 第3名 |
| 普林斯顿2010—营养学 | 第3名 |
| 普林斯顿2010—物理治疗 | 第3名 |
| 普林斯顿2010—航空航天工程 | 第3名 |
| 普林斯顿2010—计算机工程 | 第3名 |
| 2011美国最佳法学院---健康法 | 第4名 |
| 2011美国最佳法学院---知识产权法 | 第4名 |
| 2010美国最佳法学院-医疗保健法 | 第4名 |
| 普林斯顿2010—人文科学 | 第4名 |
| 2011美国最佳法学院---税法 | 第6名 |
| 2011美国最佳工程学院-生物工程 | 第8名 |
| 2010美国最佳工程学院-生物工程 | 第9名 |
| 2011美国最佳经济学院---发展经济学 | 第11名 |
| 2010美国最佳医学院-老年医学 | 第13名 |
| 2010美国最佳经济学院-产业组织 | 第13名 |
| 2011美国最佳美术学院 - 绘画 | 第14名 |
| 2011美国最佳医学院---老年医学 | 第18名 |
| NRC排名-经济学 | 第21名 |
| NRC排名-宗教学 | 第22名 |
| NRC排名-艺术史 | 第25名 |
| NRC排名-古典文学 | 第26名 |
| NRC排名-地理学 | 第27名 |
| USNews2010美国大学国际学生比率排名 | 第29名 |
| 2009世界大学学术排名——经济商务 | 第34名 |
| 2009世界大学学术排名——临床医学 | 第36名 |
| USNews2010美国本科最有价值综合性大学排名 | 第38名 |
| 2012美国最佳工程学院 | 第39名 |
| 2009世界大学学术排名——社会科学 | 第40名 |
| NRC排名-社会学 | 第44名 |
| NRC排名-数学 | 第47名 |
| 2010 生命科学&生物学 | 第48名 |
| NRC排名-西班牙语 | 第49名 |
| NRC排名-人类学 | 第51名 |
| 2009世界大学学术排名-自然科学与数学 | 第52名 |
| 2012USNEWS美国大学综合排名 | 第53名 |
| 美国大学博士项目总分TOP60 | 第53名 |
| 2009世界大学学术排名—计算机科学 | 第53名 |
| USNews2010美国大学本科升学率排名 | 第54名 |
| 2012美国最佳教育学院 | 第55名 |
| USNews2011美国大学本科综合排名 | 第56名 |
| 2010美国与加拿大大学排行榜TOP100 | 第56名 |
| NRC排名-计算机科学 | 第58名 |
| 2010 艺术与人文科学 | 第65名 |
| 2009世界大学学术排名——数学 | 第76名 |
| 2009世界大学学术排名——物理 | 第79名 |
| Forbes2012全美最佳本科院校排名 | 第82名 |
| USNews2010美国大学本科录取率排名 | 第87名 |
| 2010 自然科学 | 第115名 |
| 英国大学艺术与设计专业排名 | 第139名 |
| 2010 工程/科技 | 第139名 |
