全校共有十七个学院，例如
艺术学院(College of Fine Arts)、
波士顿大学传播学院(College of Communication)、
教育学院(School of Education)、
牙医学院(Gold man School of Graduate Dentistry)、
工学院(College of Engineering)、
法学院(School of Law)、
文理学院(College of Arts and Science)、
商学院(School of Management)、
医学院(School of Medicine)、
大都会学院(Metro politan College)、
公共卫生学院(School of Public Health)、
社会工作学院(School of Social Work)
神学院(school of Theology)
酒店管理学院(School of Hospality Adiminstration)
共包括两百五十个以上不同的科系，为一完整的综合大学。其中，大都会学院为波士顿大学的一大特色，专为社会人士提供在职进修的机会。
