中国科学技术大学工程科学学院成立于1998年，由当时的 力学和机械工程系、精密机械与精密仪器系以及热科学和能源工程系组成。伍小平院士、崔尔杰院士先后担任过本学院院长，现任院长为杜善义院士。力学和机械工 程系原名近代力学系，系功勋科学家钱学森院士于1958年创建，并任系主任直至1978年;1992年更名为力学和机械工程系，2007年恢复为近代力学 系。热科学和能源工程系的前身——工程热物理系为著名科学家吴仲华院士于1958年创建，并任系主任至1960年;此后该系撤销，且作为工程热物理专业并 入近代力学系;1983年该专业恢复成为工程热物理系，1992年更名为热科学和能源工程系。精密机械与精密仪器系为1978年在近代力学系基础教研室的 基础上创建的;而该教研室的前身则是1958年建校时成立的校机电工程教研室(承担全校工程基础教学)的机械教研组，该教研组于1963年并入近代力学 系。2004年依托我校火灾科学国家重点实验室而建立的安全科学与工程系，挂靠在工程科学学院;2001年按钱学森先生倡导成立的中国科学院材料力学行为 和设计重点实验室也属工程科学学院。
工程科学(Engineering Science)也称技术科学，属于应用科学层次，是自然科学和工程技术之间的桥梁。科大建校时诸多的系科定位于工程科学，这些系科与传统的工学院的相关 系科是不同的。前者面向工程科学，主要培养解决工程中科学问题的研究型人才;后者直接面向工程技术，主要培养工程技术人才。实际上，设置诸多的工程科学类 型的系科，是科大先进的办学思想之一——“科学与技术相结合，理与工相结合”的重要组成部分。现代科学技术的进步，特别是高新技术的飞速发展，给工程科学 的发展注入了新的活力，也向工程科学提出了新的挑战。工程科学学院就是在这样的背景下组合相关的系科而成立的，旨在整合有限的资源，促进学科之间的交叉融 合，尤其是促进工程科学与高新技术之间的交叉融合。
近五十年来，工程科学的相关系科及其专业设置已经发生了诸多的变革，但这些变革始终没有偏离科大另一个先进的办学思想——“面向科技前沿、重基础、宽口径地 培养研究型科技人才”。所谓“重基础、宽口径”是指重视数理基础和工程基础;但基础科学(理科)和工程科学的系科对工程基础的要求程度是不同的，前者侧重 工程基础知识，后者不仅要求掌握工程基础知识，还要求具备相当的工程技术能力。工程科学学院成立后，整合了原有相关系科的教学实验室，充分利用学校投资建 立了工程基础实验教学中心，该中心更多更系统地体现了高新技术对工程基础的渗透，从而促进了工程基础教学的发展。所谓的“面向科技前沿”是指让高年级学生 以选修课的方式，以及去相关的前沿科研实验室(中科院或本校的)参加一定的科研实践;这样不仅能开拓学生的视野，接触科技前沿，而且能够锻炼学生的实际工 作能力，更有利于培养学生“理实交融”的品格。目前工程科学学院设有5个本科专业(参见相关系科的介绍)，即理论与应用力学、机械设计制造及其自动化、测 控技术与仪器、热能科学和动力工程专业以及安全科学工程专业。理论与应用力学专业为全国仅有的两个理科力学人才培养基地之一。
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