西澳大利亚南街（South Street）校园
南街校园位于珀斯中央商务区以南13公里，在弗莱曼特尔以东8公里，周围灌木丛丛，十分美丽，占地227公顷，也是澳大利亚最大的校园。
校园的地理位置适中，为学生在这个大都市区内出行提供了便利。在珀斯和莫道克大学、弗莱曼特尔和莫道克大学之间的公共汽车往来频繁。在莫道克火车站也有定点开往珀斯市的火车，而且只需要11分钟就到了。
南街校园的设施丰富，包括完善的兽医院和农场（西澳大利亚唯一的马类手术室）、工程试点工厂、书法诊所、配备了最先进的电视广播演播室的媒体艺术中心、新闻室和剪辑室等等。
西澳大利亚皮尔校园（Peel）
皮尔校园和罗金汉姆校园的联系十分密切，护理专业更是该校园的特长学科。它离莫道克大学的主校园只有大约30分钟的火车车程。皮尔校园的学生可以使用专门修建的护理专业设施，护理专业学生在学习过程中，还会专门到医院实习，为学生带来亲手实践的机会。