日本政府奖学金留学生的招生有以下3种方式：大使馆推荐、大学推荐、日本国内录取。
在中国国内可以通过大使馆推荐的项目有以下五种。研究留学生，青年领导者项目，教员研修生，日本语日本文化留学生，专修学校留学生。研究留学生未满35岁，硕士毕业者(含即将毕业者)。只有到日本申请攻读博士课程的人才可以申请该项目。(如果是大学推荐或日本国内推荐的话是可以申请硕士课程的，但是在中国通过大使馆推荐的人员根据两国政府协议必须是到日本攻读博士课程的人员，请留意这一点)。
日本政府博士生留学生项目(110名)
不会日语的留学预定人员将从当年秋季开始赴长春留日预备学校(东北师范大学内，国家留学基金管理委员会运营)学习十个月左右的日语，然后于下一年的10月赴日留学。
日本国内录取的招生
1)在日本国内大学在籍的自费留学生，由在籍大学推荐，被录取为国费外国留学生的方式为“国内录取”。录取对象为在籍日本的大学院正式课程或即将升入大学院正式课程的自费留学生、以及大学的正式生即将升入4年级(医学等为6年级)的自费留学生;经过选考从4月份开始成为国费留学生。除短期大学以外，在各国立、公立及私立大学实施招生。
2)各大学经过严格选拔,挑选出品学兼优的学生,于每年12月中旬前向文部科学省推荐。
3)这种推荐也同日本大使馆没有关系。
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