与西班牙其它历史悠久的大学相比，马拉加大学还是一所较新的大学。它因马拉加市民的广泛要求而建于上个世纪60年代。其建立者是该城市的重要人物，他们的目的就是要建立一个高等教育中心，后来他们被集体命名为马拉加大学的朋友协会。马拉加大学最终创建于1968年，并于1982年8月18号被法律正式承认。
如今，仅仅30年不到，因为支持马拉加市的21世纪的技术发展研究，大学已经成为城市的文化中心。大学协助建造了飞机场和安达鲁西亚的科技园。大学源源不断提供科技观念，其毕业生极其符合这些领域的要求。这就是为什么马拉加大学不仅仅受到西班牙学生的欢迎，也受到国际学生的欢迎的原因。目前大学已有12个系科、11个院校就读的在读本科生、研究生已经大约有40000名，新的专业课程正在逐年增加。
国立马拉加大学和世界上250所高等院校签定了双边协议，通过Soctates-Erasmus交流项目，欧盟的学生可以流通;因为大学有两个校园。因为是西班牙南部重要的城市，马拉加拥有各种交通方式，包括飞机，火车和大巴。