在日本生活超过90天以上的人都需要到居住地所在的市政府(市或区役所)进行外国人登录。须携带材料：护照，两张照片(45mx35mm，申请前6个月以内的照片)。登录手续免费。
外国人登录证书必须随身携带，这是日本法律规定，也便于必要时能出示此证。
登记事项变更时
当下述登记事项发生变化时，请在变化当日起14天以内，到所在地区役所的市民科办理变更申请手续。登记事项：住址、职业、在留资格、国籍、在留期限、工作单位、孩子出生、有无配偶等。
重发、换发和缴回
外国人登录证遗失、被盗等时，请在发现的当天起14天内到所在地区役所市民科办理登记手续。另外如外国人登录证严重损毁或弄脏时，可申请换发。
持有外国人登录证的人，在没有再入国许可的情况下离开日本时，要将登录证交还日本入国审查官。另外，外国人在取得日本国籍后，或完成学业离开日本时须将外国人登录证交还。
2.在留期间的更新
在留期间到期前的10～60天内，可持有效证明材料到入国管理局进行更新申请。在留学身份发生变化时，应尽快申请变更。所需材料：在留资格更新申请书(材料在各入国管理局有)，护照，外国人登录证明书，入学许可书(或在学证明书)，成绩证明书(研究生提交研究成果证明材料)，经费支付能力证明材料(存款证明等)，研究内容或听讲科目及时间数证明材料(研究生或科目履修生者需要)。有时审查官会要求提供其他材料。手续费需要4000日元。
3.在留资格变更申请
在由语言生、研究生等身份转入专门学校、大学、大学院留学生等身份发生变化的时候，应到入国管理局进行在留资格更新申请。所需材料：在留资格更新申请书(材料在各入国管理局有)，护照，外国人登录证明书，入学许可书(或在学证明书)，经费支付能力证明材料(存款证明等)，研究内容或听讲科目及时间数证明材料(研究生或科目履修生者需要)。手续费需要4000日元。
4.再入国
在留期间，如需要临时离开日本，须办理再入国手续。否则再回日本时，你将会被要求重新申请签证。再入国分为一次再入国和多次再入国(在签证有效期间可多次出入日本)。所需材料：再入国许可申请书(材料在各入国管理局有)，护照，外国人登录证明书，学生证或身份证。一次再入国须交纳手续费3000日元，多次再入国须交纳6000日元。
5.护照更新和补办
留学生持有的中华人民共和国护照如果到期，在到期前半年，可以到中国驻日使领馆办理护照的更新。如果护照丢失，也应立即到使领馆补办新的护照，由于补办护照的手续非常复杂、周期长(需要警察署开具证明，提供登录原票证明等，至少需要3个月的时间)，因此，请广大留学生一定妥善保护好自己的护照。