日本名古屋大学共分为三个校区：文系学部、资讯文化学部、理学部、工学部、农学部在东山校区，医学部医学科及医学部附属医院在鹤舞校区，医学部保健学科在大幸校区。
东山校区
东山校区的校地主要是呈长方形状，面积约为700,000平方米。校园中有一条南北向的大道将校园分成东西两部。在校园中心有一块绿化区，向东通往丰田讲堂;向西则是中央图书馆。西区南侧主要供文部使用。
大幸校区
大幸校区在名古屋市东区，校地面积是鹤舞校区的一半。主要措施有北部的保健专业本馆、南馆、配楼，中心部位大幸医疗中心，以及南部运动场等。校园的东边是爱知教育大学附属名古屋小学暨初级中学，西南边则是名古屋巨蛋。附近有名古屋巨蛋前矢田车站，也叫做砂田桥车站。
鹤舞校区
鹤舞校区横跨昭和区鹤舞町和千种区花田町，面积是东山校区的八分之一。主要设施有北部的研究大楼、图书馆的医学系分馆等，南部有附属医院的病房大楼和诊疗大楼等。校园东侧是名古屋工业大学，南侧邻接的是鹤舞公园，北侧面向着若宫大通。车站是鹤舞站。