生物学技术往往生成大量的嘈杂数据。与数据挖掘类似，生物信息学利用数学工具从大量数据中提取有用的生物学信息。生物信息学所要处理的典型问题包括：重新组装在霰弹枪定序法测序过程中被打散的DNA序列，从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构，利用mRNA微阵列或质谱仪的数据检验基因调控的假说。
生物信息学与计算生物学
有些人将计算生物学作为生物信息学的同义词处理;但也有些人认为计算生物学和生物信息学应当被当作不同的条目处理，因为生物信息学更侧重于生物学领域中计算方法的使用和发展，而计算生物学强调应用信息学技术对生物学领域中的假说进行检验，并尝试发展新的理论。
大学排名
1 斯坦福大学Stanford University Stanford, CA
2 麻省理工学院Massachusetts Institute of Technology Cambridge, MA
3 哈佛大学Harvard University Boston, MA
4 加州大学伯克利分校University of California–Berkeley Berkeley, CA
5 华盛顿大学University of Washington Seattle, WA
5 圣路易斯华盛顿大学Washington University in St. Louis St. Louis, MO
7 约翰霍普金斯大学Johns Hopkins University Baltimore, MD
8 加州大学旧金山分校University of California–San Francisco San Francisco, CA
8 耶鲁大学Yale University New Haven, CT
10 普林斯顿大学Princeton University Princeton, NJ