莫道克大学设有多种多样的本科、硕士和博士课程。课程涉及的领域有：贸易；信息技术；政治学和国际研究；工程学；环境科学；数学和物理科学；社会科学；人类学；教育学；媒体研究；通讯研究；心理学；科学和技术；兽医科学；生物医疗科学；亚洲研究；可持续发展。
◆商务
课程设置灵活，你可以自由选择选修课程、双专业甚至双学位
提供15种不同的专业，以及不同的学位
莫道克大学的商科毕生生在众多大型的跨国企业工作，例如：雀巢、可口可乐等。
会计课程受到澳大利亚会计师协会、国家会计师协会、以及特许会计师协会的认证
人力资源管理受到澳大利亚人力资源管理学会认证
工商管理（国际商务专业）为学生提供在中国5个星期的实习机会
另设有银行业、商务法、中国商务、经济学、企业与商务革新、金融、旅游酒店管理、国际商务、管理、市场与媒体、市场管理、工商管理等课程。
◆教育学
教育教学水平排名澳大利亚第2名
莫道克大学的教育学课程受到教师协会的认证，毕业生具备成为澳大利亚注册教师资格
课程包括：教育学本科、教育学本科（研究生阶段）、教育学毕业生文凭、教育学硕士、教育学博士
◆健康科学
最顶级的设备，提供大量实习
莫道克拥有澳大利亚唯一的在校农场、动物医院、心理诊所、护士实习病房以及指压按摩诊所
护理学院的所有课程全部受到西澳大利亚护理以及助产士协会认证；毕业生具备注册成为澳大利亚注册护士的资格
Peel校区还可以享受5分额外的地区性移民加分
药剂学学生毕业以后具备成为澳大利亚注册药剂师资格。
莫道克所有心理学课程（除Counseling外）全部受到澳大利亚心理协会承认，毕业生具备成为注册心理医师资格；任教于心理学院的教师是澳大利亚最具资格的心理学讲师，连续被毕业生评为最佳心理学教师；全国课程评估评定莫道克心理学为最高级别的教学和学生满意课程；心理学院拥有最先进的心理学诊所。
莫道克兽医科学课程是澳大利亚第一个受到美国兽医协会承认的课程；学生在校园的医院即可实习；莫道克大学拥有对公众24小时开放的兽医诊所，每年接收超过14，000各类生病的动物。
莫道克指压按摩及运动科学学院拥有对公众开放的在校诊所，包括11间病房、设备齐全的复健中心、最先进的数字X光检测设备等；莫道克所有指压按摩课程全部受到澳大利亚指压按摩教育协会的认证。
◆大众传媒与文化学
莫道克的媒体技术中心的媒体制作设备是所有澳大利亚校园中最先进的。
包括：
一个录制中心
两个电视中心
三个电台广播中心
四个前沿的剪辑中心
九个影视剪辑中心
一个发布和多媒体实验室，先进的音频剪接中心、新闻演播大厅等等
荣获各项世界大奖，包括Martin Mhando博士获得奥斯卡最佳外语片提名，Julius Avery莫道克大众传媒的毕业生荣获61届嘎纳电影节大奖；以及Julian Argus编剧/导演-莫道克毕业生制作的影片作为澳大利亚的代表作被选送好莱坞Hollywood以及伦敦
大众传媒学院的教师都是行业内的资深人士，传授学生实际的制作经验；学院可以为优秀的学生提供职业实习机会
◆信息技术
莫道克大学的信息技术课程均根据行业需求而设计，这既意味着当你毕业以后非常容易在IT界找到工作。
同时学生还可以在多样化的IT专业中进行选择，包括：游戏技术 、游戏软件设计和制作、商务信息化、商务信息系统、数码法医、信息安全和管理、网络安全与管理以及计算机科学。
◆工程学及能源学
莫道克大学拥有世界上5所之一的工程实验工厂，为学生提供了最好的学习实际操作的条件。莫道克大学的工程教学排名澳大利亚第5名。
工程学院包括6个不同领域的研究中心，例如：可持续能源研究所(RISE)。
大量工作机会，在未来的20年内，全世界仅在可再生能源（风力、太阳能、生物能源、地热）这一个领域就有超过三百万个工作机会
莫道克的工程学为学生提供在西澳顶级企业的实习机会，以及跨专业学习的机会
可以根据职业规划增加商科学位或者科学学位。
根据莫道克的“灵活课程设置”以及“快捷学位”原则，学生可以前所未有的在最短的时间具备最好的职业技能。
◆环境科学
莫道克是澳大利亚第一所开设环境科学课程的大学
联合国环境技术中心设于校内。环境科学学院的毕业生以优良的技能和素质而闻名，课程包括：生态旅游学、环境工程、环境恢复、环境科学、以及环境技术等。
学生将有机会在不同的地区参与实地考察和研究。
◆社会科学及人文科学
莫道克的历史学科是澳大利亚排名第一的学生最满意的课程
英语、创造艺术、哲学则以教学技巧排名澳大利亚第一
安全、反恐怖主义与政治、以及国际研究排名西澳大利亚第一
课程还包括：社区开发、旅游学、社会学、神学、亚洲研究、公共政策
◆生物科学与生物技术
莫道克大学是第一个开设生物技术课程的澳大利亚大学
同时也是澳大利亚州际农业生物技术中心(SABC)的合作伙，SABC是澳大利亚最大的生物技术研究中心，落座于莫道克大学校内
莫道克大学为学生提供双专业甚至三专业的选择，包括从生物课程、生物技术+商务、野生生物保护、毒理学、海洋科学、分子生物学、生物医学、法医生物学+犯罪学等
◆法律学
在370万澳币建造的多功能法律系教学楼中
为学生提供实习的机会。莫道克的法律学位受到很多国家的认证，在世界上很多地方都可以看到莫道克毕业的律师。
Juris Doctor不限背景，对任何专业的本科学位学生开放，毕业生具备成为注册律师的资格。其他课程包括：犯罪学、法律研究、法律以及其他专业的双学位
莫道克大学法律系
◆化学与数学
冶金学课程全部受到澳大利亚冶金和矿物协会承认，且行业协会Parker Center位于莫道克大学校内。
莫道克化学与数学课程顺应现代科学家和工程师的需求，以信息技术为基础，并提供具有吸引力的双专业以及双学位。
◆可持续发展学院
莫道克大学是澳大利亚唯一一所开设可持续发展本科课程的大学。
可持续发展学院的学生将会在澳大利亚最先进的可持续性研究中心上课，并与专家共同研究最前沿的课程，例如：可持续发展城市、绿色科技、以及第三世界发展等。