在课程设置方面，专业硕士课程较多，一般有10到15门课程，再加课题报告或实习报告。而研究硕士课程一般4到8门，再加论文。报告由指导老师阅后打分，而论文必须答辩。课程内容方面，专业硕士课程注重实践，并常与专业协会的考试内容有关。如会计硕士的课程被会计师协会的考试认可，金融硕士的课程被金融分析师承认，工程硕士的课程被工程师协会认可。学生毕业后可凭硕士课程的学分，免修专业协会的课程，而直接参加专业协会的资格考试。研究硕士的课程重视理论、模式、创新的概念。专业硕士一般能在12至18月内完成硕士学位学习，研究硕士完成时间一般在一年半至三年，视其完成论文答辩时间而定。
几乎所有加拿大的大学都有研究硕士项目，但是每个大学只开设为数不多的专业硕士项目。因为教授们一般不愿带专业硕士，这类学生对教授的研究，发表文章帮助不大。而且聘请能上专业课的教授，学校要付更高的工资，有些教授来自于专业领域，薪酬更高，这也是为什么专业硕士的学费要比研究硕士的学费贵。有些大学没有足够的具有专业知识的教授团队来承担这类硕士项目，大学之间争夺这类人才也很激烈。
因此，学生要找专业硕士项目很难。譬如，加拿大只有四所大学有会计硕士课程：多伦多大学、布鲁克大学、滑铁卢大学、萨斯卡提伦大学;只有圣玛丽大学有金融硕士课程;只有达尔豪斯大学有网络工程硕士课程;只有温莎大学有汽车工业管理硕士课程;只有纪念大学有石油和天然气管理硕士课程。
申请专业硕士一定要仔细在大学的网站上寻找。在申请过程中，专业硕士的申请程序较简单，因为无需找指导教授;研究硕士一般先要有指导教授接受。但加拿大大学很少为专业硕士学生提供奖学金，而研究硕士有可能拿到助研金或助教金。
专业硕士毕业后将面向企业界、工业界，薪水较高。研究硕士毕业后，可继续读博士，可在科研单位搞研究，或任职于政府和非牟利的民间机构，他们的薪水往往低于专业硕士毕业生。
过去，中国赴加拿大留学的研究生，由于经济条件和对加拿大研究生分类不熟悉，大都申请研究硕士，念专业硕士的学生较少。近年来，这种趋势已有所改变。