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1、东京大学
东京大学成立于 1877 年，是日本创办的第一所国立大学，也是亚洲创办最早的大学之一，公认为日本最高学府，是亚洲一所世界性的著名大学。它的前身是明治时期创办的东京开成学校和东京医科学校。如果追溯得更远些，最早是幕府时期设置的“兰学”机构“天文方”、昌平坂学问府、种痘所历经演变而来。明治维新初期，日本政府公布了“新学制令”，为向欧美学习打开门户，于 1877 年根据文部省指示将上述两校合并，定名为东京大学。 东京大学的大型计算机中心，据称是世界上最大计算机中心，装有 8 台 新型 M-200H 电子计算机系统，容量大，外围设备齐全，分时系统能力很强。由文部省直接支持，为文部省所辖大学服务。这样就构成了以东京大学为中心的东京都的计算机网络，统筹计算机的使用和调度。全东京都的大学教师和学生都有资格成为用户，为大学的教学和研究提供了方便的条件。
2、京都大学
京都大学(Kyoto University)简称京大，是继东京大学之后成立的日本第二所国立大学。1892年，23位国会议员在向国会提出的一个议案中提出，日本仅有一所东京国立大学，缺乏竞争，对办学和学生的培养都不利，建议在当时的西京——京都建一所大学，1897年议案被通过，大学得以诞生，当时定名为京都帝国大学。
3、东京工业大学
东京工业大学(Tokyo Institute of Technology, Tōkyō Kōgyō Daigaku)，是工程技术与自然科学研究为主的世界一流理工大学之一。大学的简称“东工大”，英文简称“Tokyo Tech”，隶属国立大学法人。 在英国泰晤士报教育专刊发表的2009年世界大学排名 (THE - QS World University Rankings 2009) 中，东京工业大学的综合排名为世界55位，工程与技术 (Engineering/Technology) 类大学排名世界19位 ，自然科学 (Natural Sciences) 类排名世界48位。 东京工业大学于2006年4月开发出亚洲最快的超级计算机“TSUBAME”(2007年6月)。这一计算机系统是日本国内大学首次由本科学生所研究和创造的，并可以自由使用。该系统的作用主要是，以较低的收费被校内的教育和研究所广泛使用。“大家的超级计算机”是它的昵称。
4、庆应义塾大学
庆应义塾大学(假名：けいおうぎじゅくだいがく，英文：Keio University)，简称庆应大学或庆大，乃日本名思想家福泽谕吉所创建的日本第一所私立大学，仿照英式教育风格，庆应大学以学术自由及校园内蓬勃发展的活动著名。1858年，他设立的洋学塾是源流。大学更培育出日本许多具权威及影响力的人物，如日本IBM副总裁及日本前任总理小泉纯一郎等。本部在东京都港区。
5、大阪大学
大阪大学(日语：おおさかだいがく，英语：Osaka University)，在日本通常被称呼为阪大(はんだい，Handai)。大阪大学为日本7所著名帝国大学之一，直属文部省领导 。在日本关西地区，该校是仅次于京都大学的在各个领域都起着重要作用的综合性大学。现大学拥有10个系、12个相关的研究生院、5个研究院、18个教育和研究中心、3个图书馆和2个隶属于医学系和口腔专业的医院。有1.4万多名大学生和近6000名研究生在学，教师超过2000人，管理人员也近似这个数字。
