北京大学医学部在长达近一个世纪的办学实践中，逐渐形成了“勤奋、严谨、求实、创新”的学风和“坚定正确的政治方向，严谨求实的治学态度，热忱献身的服务精神”的校风。
北京大学医学部师资雄厚，有教职工一万余人(含附属医院)，包括专业技术人员9251人，其中高级职称人员1866人，中科院、工程院院士11名，长江学者16名，国家有突出贡献专家16位,博士生导师248名。各类在校学生10196人，其中博士生1082人，硕士生1962人，本科生3115人，专科生537人，成人教育学生3500人。医学部接收来自港澳台地区学生、海外华侨学生和外国留学生到校学习。
北京大学医学部有基础医学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、公共教学部、第一临床医学院（北大医院）、第二临床医学院（人民医院）、第三临床医学院（北医三院）、口腔医学院、临床肿瘤学院（肿瘤医院）、精神卫生研究所（北医六院）、北京大学深圳医院、北京大学首钢医院、医学网络教育学院。另外，北京积水潭医院、北京医院、中日友好医院、北京世纪坛医院、中国航天中心医院、回龙观医院、中国民用航空总医院、首都儿科研究所、北京地坛医院、中国人民解放军302、306医院、京煤集团总医院、北京仁和医院也是医学部的临床医学院或教学医院。医学部内拥有教学楼、实验楼、图书馆、药学楼、公共卫生楼、医药分析中心、信息中心、电化教育中心、实验动物部、档案馆、出版社、体育馆等装备精良的教学、科研设施。
北京大学医学部学科齐全，有基础医学、临床医学、口腔医学、预防医学、药学、护理学、医学实验学、应用药学、生物医学英语等本科专业。现有12个一级学科博士、硕士学位授权点，47个二级学科博士学位授权点和59个二级学科硕士学位授权点，6个博士后流动站。北医以培养本科生、研究生为主体，长学制教育为特色，同时又是继续教育的培训基地。
1996年，当时的北京医科大学首批通过了“211工程”建设项目的论证，成为中国政府重点支持的医科大学，还被教育部确定为全国大学文化素质教育的基地，基础医学院被教育部确定为基础理科人才培养基地。目前，北京大学医学部拥有20个国家级重点学科，1个国家级重点实验室，11个省（部）级重点实验室。在全国医学院校中连续十年获国家自然科学基金第一名，完成科研课题和所获各类科研基金以及在SCI及国内刊物上发表论文数量均名列全国医学院校首位。
北京大学医学部与世界卫生组织（WHO）、联合国儿童基金会（UNICEF）、美国疾病控制中心、美国中华医学基金会（CMB）等国际组织保持着良好的合作关系，并与十几个国家和地区的20多所大学建立了良好的校际交流关系，先后聘请了60位世界著名学者为客座教授、名誉教授，其中3位是诺贝尔奖获得者。
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