学校下设基础医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、中药学院、针灸推拿学院、护理学院、经济与管理学院、信息技术学院、人文社科学院、国际学院、继续教育学院、职业技术学院 ，及脾胃研究所、临床药理研究所、热带医学研究所等。开设本科专业13个，横跨医、工、管、理、经、文6个学科门类，其中中医学、中药学和针灸推拿学是广东省名牌专业。据中国教育在线了解，广州中医药大学现有中医内科学、中医临床基础、中医骨伤科学、中医妇科学等4个国家级重点学科，国家级重点学科总数在全国地方中医药院校和广东省属高校中均居首位；国家级重点实验室（工程中心）5个，部级重点学科7个，国家中医药行业重点实验室（中心）11个，省级重点学科8个。科研成果显著，“九五”期间，学校获国家科技进步二等奖3项，国家科技进步三等奖2项，省部级科技进步奖14项。
此外，1998年，广州中医药大学成为全国首批临床医学专业学位试点单位，2002年，广州中医药大学获国家首批开展非医学专业本科毕业生攻读中医学硕博连读研究生的试点工作，2003年，广州中医药大学成为招收高校教师在职攻读硕士学位单位。
| 高考招生 | 自主招生 | 招生计划 | 高考招生简章 | 高考保送生 |