我国医药类院校按学科性质和研究偏重，有两种分类方式：
第一种，按照培养医师性质的不同分为主攻西方医学（西医）的院校和主攻东方医学（中医、藏医、蒙医等）的院校两类。
第二种，按照学科的涵盖面分为医科类大学、医药类大学、药科类大学三类，医科类大学更重医科范畴，培养医师、护理人员等，主要设有临床医学、口腔医学、麻醉学等相关专业，毕业后主要在医院部门工作；医药类大学则医科与药科并重；专业的药科类大学尤其偏于药学领域，以培养药学人才为主，主要开设药物制剂、药物工程、生物制药等相关专业，毕业后主要在制药行业、医药公司等工作。
两种分类彼此交叉，涉及到具体高校，在本科阶段又有医科大学（药科大学、中医药大学）和医学院（药学院）两个层次之分。它们的区别众所周知，前者规模和名气更大，招生门槛相对更高。
正是因为这份职业的崇高，每一年，都有无数优秀的学子投身到医学院校当中，这些高校就是他们梦想腾飞的起点。目前，国内的医学院校大概呈现两种状态，一些老牌的重点医科大学已经并入综合类大学，成为其中的一个重要学科门类。如北京大学医学部（原北京医科大学）、四川大学华西医学院（原华西医科大学）、复旦大学医学部（原上海医科大学）、华中科技大学医学院（原同济医科大学）等。而另一种，则是独立的医学院校，如天津医科大学、北京中医药大学等。两种医学类院校各有各的特点，却又为各自所在地区的医疗事业贡献着最前沿的科技力量。
合并的医学院校：
某些医药类院校并入综合大学后，就成为学校一个密不可分的总体。然而，这其中有的院校还保持着在每年高考之际，单独招生、录取。这就是北京大学医学部和上海交通大学医学院。
北京大学医学部和上海交通大学医学院都是可以采取单独招生的方式，而其他医学院在并入综合类大学之后，采取的是统一招生的方式。
如果说知名医学院校与综合院校的组合是强强联手，那么现在还单独设立的医药类院校虽是“单打独斗”，却也闯出一片属于自己的天空。此类院校数量庞大，各省（区市）均有一至两所，为了给学子勾勒出此类院校的特色。
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