日本一桥大学的教学和研究课程分别由4个学部和6个研究科(研究生院、大学院)承担，学校设有法律学部与法学研究科、经济学部与经济学研究科、商学部与商学研究科、社会学部与社会学研究科，以及言语社会研究科和国际企业战略研究科(设在东京市中心)等机构。
商学部(含经营学系和商学系)：经营学系开设的科目为经营与会计，商学系为市场和金融。
经济学部(经济学系)：经济学系有经济理论与经济统计、应用经济、经济史与地域经济。
法学部(法学系)：法学系开设了法学和国际关系学课程。
社会学部(社会学系)：社会学则有社会结构和社会文化变迁研究、人类行为研究、政策管理研究、社会文化研究、社会改造和技能提升研究、社会历史研究课程。
日本一桥大学的6个研究科下有数量不等的分野，并在不同的分野基础上设置不同的科目。比如，商学研究科有经营与会计、市场与金融两个领域，前者开设了经营、会计、经营基础科学和创新科目，后者开设有市场、金融、产业与文化、电子商务等。而经济学研究科则涵盖了经济理论与经济统计、应用经济、经济史与区域经济、比较经济与区域发展经济这几个方向，像应用经济专业就开设有经济政策、现代经济、经济地理、公共经济、环境和技术等丰富的课程。