历史沿革滨州医学院的前身是始建于1946年的原国立山东大学医学院，1956年国立山东大学迁址济南，医学院部分留在青岛独立建制为青岛医学院。1970年10月，青岛医学院整体搬迁至山东省惠民地区行署驻地北镇办学;1974年11月，设立青岛医学院北镇分院(为省属本科高等院校);1981年9月，改称北镇医学院;1983年3月，随驻地更名为滨州医学院。2002年9月滨州医学院烟台校区投入使用。
办学规模学校全日制在校生14000余人，其中本科生13000余人、硕士研究生171人，面向全国28个省(市、自治区)招生。
学科专业学校设有临床学院、基础学院、特教学院(医学二系)、口腔学院、护理学院、医学人文学院、中西医结合学院、药学院、卫生管理学院、成人教育学院等10个院(系)。设有临床医学、口腔医学、护理学、生物技术、中医学(中西医结合方向)、信息管理与信息系统、麻醉学、医学影像学、法学(医事法律方向)、统计学(卫生统计学方向)、英语(医学方向)、药学(临床药学方向)、应用心理学(临床心理学方向)、公共事业管理学、预防医学、劳动与社会保障等17个本科专业和方向，其中，口腔医学、临床医学、护理学专业为国家特色专业建设点。
学校设有人体解剖与组织胚胎学、内科学、口腔医学、免疫学、病理学与病理生理学、外科学、妇产科学、儿科学、眼科学、影像医学与核医学、皮肤病与性病学、中西医结合临床等12个硕士学位授权点。是临床医学(一级学科)硕士专业学位授权单位。
现有医学免疫学、口腔科学、临床营养支持中心(肝胆外科)、内科学、人体解剖与组织胚胎学、病理学与病理生理学等6个省级重点学科。病理学、组织学与胚胎学、儿科学等3门省级教学改革试点课程;组织学与胚胎学、病理学、生物化学、药理学、病理生理学、生理学、外科护理学等7门省级精品课程。
科学研究近五年来，学校共承担各类科研课题679项，其中国家级12项，省部级76项，厅局级99项;获省级科技进步奖5项，省软科学奖励10项，厅局级奖励98项;获省级教学成果奖10项，其中一等奖2项;出版专著、教材72部，发表论文2768篇，其中核心期刊1069篇。
主办中国医学统计类核心期刊《中国医院统计》和中国学术期刊综合评价数据库来源期刊《滨州医学院学报》，均向国内外公开发行。
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