在1994年和1998年，ISIInstitute for Scientific Information 依据在自然科学和社会科学主要研究领域中所发表论文的引文统计，将得到美国联邦政府资助的大学进行了排名排出了前100名并且在该机构出版的《科学观察》(Science Watch)上公布了其中的“前十名”。日前，ISI出版的《科学观察》(Science Watch)再次刊登了最新的排名，排名按照21个不同学科领域进行统计，列出了最近5年中在各个学科领域论文被引用率高于世界平均水平的大学。
结果显示，在这21个领域中的21个前10名(每领域1个前十名排名)排名中，依据出现在排名中的频率，哈佛大学高居榜首，共出现15次。斯坦福大学位居第二，出现11次，这种情况恰好与1988年的排名相仿，当时也是哈佛第一，斯坦福第二。除了哥伦比亚大学和杜克大学是前10名的新面孔之外，其它6所大学在1998年的排名中，已位居前10名了。
从第一到第十名分别是哈佛大学(共出现15次)，斯坦福大学(11次)，麻省理工学院(9次)，加州大学圣迭戈分校(9次)，耶鲁大学(8次)，加州大学伯克利分校(8次)，哥伦比亚大学(8次)，加州理工学院(7次)，密执安大学(7次)，杜克大学(6次)。
在此次排名中，曾在1998年排名中位居前列的3所大学因在各领域前10名排名出现次数没超过6次而未能进入上述排名前10名。它们是康奈尔大学(5次)，华盛顿大学(5次)以及加州大学圣巴巴拉分校(4次)。和以往的统计一样，《科学观察》细致研究了“ISI大学科学指标数据库”(ISI University Science Indicators)中的出版和引用数据。在21个领域基于ISI收录期刊的学科分类而定 中，它依据1997-2001年中出版和引用的论文计算了每所大学论文的平均被引频次(每篇论文平均被引用的次数，可以用来测度论文的影响力)。计算数据值与同期表明该领域影响情况的世界基准数据值进行了比较，这就产生了一个用百分数表明的“相对影响”(Relative Impact)值。例如，在临床医学领域中，哈佛大学1997-2001年间论文的平均被引频次是9.78次，而该领域世界平均值则为4.54次。因此，哈佛大学就因高出世界平均水平值的115%而位居该领域的首位，紧随其后的是高于世界平均水平106%的加州大学圣迭戈分校。
在每一领域，为了找到那些在这5年间发表了足够多重要论文的大学，《科学观察》首先依据长期的引文分析确定了发表论文的最小数量，并称之为基准值，只有在这5年间发表论文数超过这一基准值的大学才能被列入进一步排名的名单。由于不同研究领域所收录的期刊和所发表的论文数是不同的，这一基准值也是不同的。通过计算这10所大学的平均显示情况(即，每所学校在各专业前10名中的排名位置的总和除以它们在各专业前10名中的出现次数)，可以从另外一个角度观察这10所学校之间的细微差别。通过这种计算方法，加州理工学院得到了最高的平均位置分(3.14)，再往下则是哈佛大学(3.40)，杜克大学(4.50)，耶鲁大学(4.50)，斯坦福大学(5.36)，加州大学伯克利分校(5.63)，加州大学圣迭戈分校(5.78)，哥伦比亚大学(6.38)，密执安大学(6.71)。