通常我们习惯将生物工程(BE)和生物医学工程(BME)混为一谈，事实上从美国大学的院系设置也会看到，二者是相通的，研究方向会有很多重合，只不过院系名称不同而已。但从原则上讲，二者是有区别的。二者的侧重点不同。生物工程是涉及医疗、制药、食品、农业、环保、轻工等有关人类衣食住行各个行业的新兴工程领域，是运用生物学、化学和工程学等学科相结合的方法，利用生物体生产人类需要的产品，改造生态系统和环境的应用技术体系。它覆盖基因工程，生物信息学，生物反应器工程，生物分离工程，生物技术制药，农业及海洋生物工程，医用生物工程和生物工程管理。由此可以看出，生物医学工程是包含在生物工程里的，只不过现代医学研究的快速发展，使大家更为关注医疗健康，故生物医学工程专业的关注度会更高一些。
美国生物工程专业包括五大工程，即遗传工程(基因工程)、细胞工程、微生物工程(发酵工程)、酶工程(生化工程)和生物反应器工程。在这五大领域中，前两者作用是将常规菌(或动植物细胞株)作为特定遗传物质受体，使它们获得外来基因，成为能表达超远缘性状的新物种——“工程菌”或“工程细胞株”。后三者的作用则是这一有巨大潜在价值的新物种创造良好的生长与繁殖条件，进行大规模的培养，以充分发挥其内在潜力，为人们提供巨大的经济效益和社会效益。
【美国生物工程专业课程设置】
美国生物工程专业硕士段核心课程(core courses)：
Molecular, Cellular and Tissue Biomechanics分子，细胞与组织生物力学
Cell-Matrix Mechanics细胞基质力学
Biomolecular Kinetics and Cellular Dynamics生物分子动力学与细胞动力学
Fields, Forces, and Flows in Biological Systems生物系统中的场，力与流
Analysis of Biological Networks生物网分析
Biomaterials-Tissue Interactions生物材料与组织的反应
Design of Medical Devices and Implants医疗器材的设计与应用
Molecular Principles of Biomaterials生物材料的分子原理
美国生物工程专业申请要点
一般来说，美国生物工程专业的录取标注大致如下：GPA：3.0;TOEFL：100;GRE：Q800。这是语言和平均成绩的要求，而对于理工科来说，美国大学最为关注的还是你的软性条件，也就是你的实验能力，你的综合能力。如果你是工程专业的学生，并辅修过生物化学的课程，那么申请生物工程专业的话就会加分不少。
