3.国家机关工作人员利用职权实施的侵犯公民人身权利和民主权利的犯罪
具体包括：①非法拘禁案;②非法搜查案;③刑讯逼供案;④暴力取证案;⑤报复陷害案;⑥监管人员殴打、体罚、虐待被监管人案;⑦破坏选举案。
注意：⑴人民检察院直接受理的这类案件对犯罪主体有特殊要求，即犯罪主体必须是国家机关工作人员，如果不是国家机关工作人员从事这些犯罪，那么就应当由公安机关立案侦查，而不是人民检察院立案侦查。根据刑法的规??主体都是一般主体，并不限于国家机关工作人员;而刑讯逼供罪、暴力取证罪的犯罪主体是司法工作人员，虐待被监管人罪的犯罪主体是监狱、拘留所、看守所等监管机构的监管人员，报复陷害罪的犯罪主体是国家机关工作人员，这四个罪名的犯罪主体范围都小于或等于“国家机关工作人员”的范围。由此可以得出结论：所有的刑讯逼供案、暴力取证案、报复陷害案、监管人员殴打、体罚、虐待被监管人案都是由检察机关立案侦查的，但并非所有的非法拘禁案、非法搜查案和破坏选举案都是由检察机关立案侦查的，只有国家机关工作人员利用职权实施的这三类犯罪才由检察机关立案侦查，其他人实施的这三类犯罪应由公安机关立案侦查。⑵下列国家机关工作人员利用职权实施的侵犯公民人身权利和民主权利的犯罪，由公安机关管辖：①非法剥夺公民宗教信仰自由罪(《刑法》第251条);②侵犯少数民族风俗习惯罪(《刑法》第251条);③打击报复会计、统计人员罪(《刑法》第255条)。
4.对于国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。
这类案件必须符合以下条件：①犯罪主体必须是国家机关工作人员;②在犯罪程度上必须是重大犯罪;③在犯罪手段上必须是利用职权实施的，对于属于国家机关工作人员但不属于利用职权实施的案件，例如国家机关工作人员实施的强奸罪，如果公安机关不立案或撤销案件的，人民检察院不能经省级以上人民检察院决定而直接立案侦查，只能根据《刑事诉讼法》第87条规定的程序对公安机关的不立案进行监督。④在审批程序上必须经省级以上人民检察院决定。审批程序是：基层人民检察院或者分、州、市人民检察院需要直接立案侦查时，应当层报所在的省级人民检察院决定。分、州、市人民检察院对基层人民检察院层报省级人民检察院的案件，应当进行审查，提出是否需要立案侦查的意见，报送省级人民检察院。报请省级人民检察院决定立案侦查的案件，应当经检察委员会讨论决定，制作提请批准直接受理书，写明已经查明的案件情况以及需要由人民检察院立案侦查的理由，并附有关材料。省级人民检察院应当在收到提请批准直接受理书后的十日以内，由检察委员会讨论作出是否立案侦查的决定。省级人民检察院可以决定由下级人民检察院直接立案侦查，也可以决定直接立案侦查。(《人民检察院刑事诉讼规则》第10条)
注意：上级人民检察院在必要的时候，可以直接侦查或者组织、指挥、参与侦查下级人民检察院管辖的案件，也可以将本院管辖的案件交由下级人民检察院侦查;下级人民检察院认为案情重大、复杂，需要由上级人民检察院侦查的案件，可以请求移送上级人民检察院侦查。(《人民检察院刑事诉讼规则》第14条)
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