加州大学伯克利分校的组织结构是：以传统的多学科综合的文理学院为主，以新兴学科和专业学院为辅。全校共有3个法学院，5个医学院，14个学院，大多数学院下面还设有系。
1.文理学院
文理学院是西方教育体制中一种传统的分学科综合教育组织，以系为主干，伯克利的文理学院是14个学院中最重要的，也是学生人数最多的一个学院，它共有6个学部，46个系。
文理学院的许多系都提供辅修学位，各部院系如下：
生命科学部：生物学系、分子和细胞生物学系、生化和分子生物学系、细胞和发展生物学系、基因学系、免疫学系、细胞核生物学系和生理学系
人文科学部：艺术史系、艺术实践系、古典艺术系、比较文学系、戏剧艺术系、东亚语言系、英语系、法语系、德语系、意大利研究系、音乐系、近东研究系、哲学系、修辞系、斯堪的那语系、斯拉夫语言文学系、南亚和东南亚研究系以及西班牙语和葡萄牙语系
物理科学部：天文学系、地质地理系、数学系和统计学系
社会科学部：美洲黑人研究系、人类学系、民主学系、经济学系、民族学研究系、地理系、历史学系、语言学系、政治学系、心理学系、社会学系和女性学系
跨学科和本科生教育部：美国研究项目、认知研究项目、创造性写作项目、环境科学项目、交叉学科研究项目、法律制度研究项目、女同性恋、男同性恋、双性恋和变性研究项目、大众传播研究项目、宗教研究项目、亚洲研究项目、发展研究项目、拉丁美洲研究项目、中东研究项目、和平和冲突研究项目、工业社会的政治经济研究项目、本科研究项目、国防教育研究项目等
2．商学院
提供本科生项目和研究生项目。研究生项目包括：M.B.A；J.D./M.B.A（和法学院合办）；M.B.A/M.P.H.（和公共保健学院合办）；M.B.A/M.A；工商管理硕士和亚洲研究；E.M.B.A；在职的MBA和管理学的PH.D。
3．化学学院
下设3个系，化学、化工和生化
4．教育研究院
提供认知和发展教育；语言文学文化教育；政策、组织、衡量和评价等研究领域。提供本科辅修项目。
5．工学院
下设市政工程系、电子工程和计算机科学系、工业工程和运筹学系、材料科学和采矿工程系、机械工程系、海上建筑和海岸工程系、核技术工程系。提供六个双学位项目。
6．环境设计学院
下设建筑系、城市和区域规划系和景观建筑系。提供本科辅修项目。
7．新闻研究院
提供法律项目、亚洲研究项目和拉丁美洲研究项目。只提供硕士学位。
8．法学院
提供J.D.法律专业博士项目（高级职业学位）；L.L.M.法律硕士项目(为外国律师提供的学位)；J.S.D.法律科学博士项目；M.A./PH.D；法律和社会政策硕士；哲学博士项目。
9．信息管理和系统学院
提供信息管理和系统的硕士学位和如下哲学博士学位：信息用户和社会；信息组织的管理和服务；信息经济学；信息检索；信息技术；系统分析和设计；信息政策。
10．自然资源学院
下设农业和资源经济系、环境科学系、营养科学系、植物科学系。提供本科辅修项目。
11．眼科学院
提供视力科学项目。
12．公共保健学院
提供卫生统计项目、环境卫生科学项目、传染病研究项目、健康服务和政策分析项目、免疫项目、微生物项目、健康和药学项目、基因咨询项目。
13．公共政策学院
提供本科辅修项目、公共政策硕士项目、公共政策哲学博士项目。
14．社会福利学院
提供社会福利哲学博士项目、社会福利硕士项目(为准备参加社会福利实际工作者提供的项目)。
师生的基本数据
1．师资
加州大学伯克利分校拥有阵容强大的教师队伍。据1997－1998年度的统计，全校共有教授1,661人，其中男教授占77％，女教授占23％，少数民族占16％，获得终身职位的教授占80％,有8名诺贝尔奖金获得者，121名美国科学院院士，76名美国工程科学院院士，198名美国艺术科学院院士，140名Guggenheim奖获得者，22名MacArthur奖获得者，3名普利策奖获得者。
雄厚的师资为伯克利分校的教学质量和科研发展奠定了坚实的基础，同时也为加州大学伯克利分校吸引了许多优秀的学生，并且在一定程度上提高了学校的声誉，为学校吸引来了大量的科研资金。
伯克利分校设有许多重要的研究机构，其中有美国能源开发署的三个重要的世界闻名的大型研究中心：劳伦斯伯克利实验研究中心、劳伦斯弗莫尔实验室和阿拉莫斯科学实验室。其中，劳伦斯伯克实验研究中心是享誉世界的物理学研究中心。
2.本科生学习
伯克利分校优秀的教学质量和良好的声誉吸引了众多优秀的高中毕业生，因而入学竞争格外激烈。加利福尼亚州全州最优秀的高中毕业生才能进入加州大学学习，约为整个高中毕业生的12.5％。而能就读于伯克利分校的大概只有1％。进入伯克利学习的学生也格外追求上进。据统计，在伯克利分校获得学士学位后又继续深造获得博士学位学生的比例比其他任何一所美国大学都要高。伯克利分校实行四年制本科生教育制度，学生只能主修下面七个学院的项目：化学学院；工程学院；环境设计学院；文理学院；自然资源学院；商学院和眼科学院。
伯克利分校现有本科生21,738人，其中男生10,948人，女生10,790人。
除大多数学生系加州的公民外，还有来自全美国各州和全世界100多个国家的留学生。伯克利分校的学生中不少人都是来自具有不同文化背景的少数族裔，他们和白人学生共同构成了伯克利大学丰富的多元文化氛围。下面是1999－2000年本科生种族比例。
本科课程设置：
化学院：化学生物、化学工程、
工程学院：生物工程、土木工程、计算机工程科学、电子电气工程、工程数学统计学、工程物理学、环境工程学、工业工程及运筹研究、制造工程、材料科学与工程、机械工程、核能工程
环境设计学院：建筑学、园林建筑学、城镇研究
文理学院：非裔美国人研究、美国研究、古埃及及近东美术与考古学研究、人类学、美术史、美术实践、亚裔美国人研究、亚洲人研究、天体物理学、生物化学、细胞发育生物学、凯尔特语研究、化学、卡奇诺研究、汉语、古典文明、古典语言、认知学、对比文学、计算机科学、舞蹈表演艺术学、发展研究、荷兰研究、地球及行星科学、经济学、英语、环境经济与政策、环境科学、种族研究、电影研究、法语、性别及女性研究、遗传学、地理学、德语、希腊语、西班牙语及双语争端研究、历史、伊比利亚及拉丁美洲文学、免疫学、综合生物学、跨学科研究、意大利研究、日语、拉丁语、拉丁美洲研究、法学、语言学、数学、应用数学、媒体学、中东研究、分子细胞生物学、音乐、美国本土研究、近东文明、近东语言与文学、神经生物学、运筹管理学、和平与冲突研究、哲学、物理科学、物理学、政治经济学、政治学、心理学、公共健康学、宗教研究、修辞学、斯堪的纳维亚语、斯拉夫语言与文学、社会保障学、社会学、南亚及东南亚研究、西班牙及拉丁美洲裔居民、统计学、戏剧表演学、
自然资源学院：保护与资源研究、环境经济与政策、环境学、森林与自然资源、遗传与植物生物学、微生物学、分子环境生物学、分子毒理学、营养学、社会与环境、
哈斯商学院：商业管理
3．研究生学习
伯克利分校拥有全美最大的的研究生部，提供了近100个专业的学位项目。现共有硕士、博士和博士后研究生9,262人，占学生总数的三分之一。1997－1998年度共授予硕士1,632人、博士752人、职业性学位340人。