1、学习奖励费：日本文部省实行对在日大学等高等教育机构就学的外国留学生实施奖学金制度，向在日本大学等高等教育机构中注册的成绩优秀学生颁发学习奖励费；自2000年起，这项奖励也开始面向在日本语教育机构注册的学生，颁发金额为：日本语教育机构和本科生每月50000日元(人民币3800元)/人，研究生每月70000日元(人民币5300元)/人；每年有1万名左右的学生获得这项奖励，发放学习奖励费的具体事项由财团法人日本国际教育协会办理。
2、学费减免措施：每年约3万学生可以得到不同程度的学费减免，其中政府为私立大学或短期大学提供不超过学费的30%额度的补助。
3、医疗补助：在日本高等教育机构注册的学生，在其生病或发生意外伤害时，可享受80%的医疗补助。
4、公费录取：对即将升入研究生院的留学生和在籍研究生院或大学本科最高年级学习的留学生中成绩优秀者按照公费留学生录取；此外，留学生还可以获得每周28小时以内的打工许可。
名目繁多的奖学金项目
1、政府奖学金
在众多奖学金中，最令留学生渴望得到的是文部省奖学金；这项资金由1954年设立，金额足以解决留学生的学费、生活费；此外，还有其他津贴；所以一经获接纳，取得这项奖学金，俨如日本的“国费生”；日本政府发放奖学金的方法，一种是通过日本驻外使馆向国内文部省推荐；另一种方法是通过日本国内的大学向文部省推荐。
2、民间奖学金
日本有些民间团体也向赴日留学生发放奖学金，这些奖学金的其中一种类型是冠名留学奖学金，由财团法人日本国际教育协会统理。如：神内留学生奖学金、关西PAINT奖学金等数十项；除此以外，日本大学的奖学金还有自费外国人留学生学习奖学金、地方自治体奖学金(26个地方自治体、37个地方国际交流团体提供)、学校奖学金(233所大学提供奖学金)和民间团体奖学金(157个)。奖学金的申请以已经入学的自费留学生为对象。
奖学金可足够支付留学生所需要全部费用的很少，大多是只够分担生活费，学费等的一部分；根据2004年3月财团法人日本国际教育协会的自费外国留学生调查，有44.4%的自费外国留学生得到奖学金，平均月额60，000日元。而根据2003年10月的财团法人日本语教育振兴协会的调查，就学日语教育机关的学生，得到奖学金的人数只占15%，平均月额为43，117日元。
如何申请奖学金
在手续上，奖学金可分为赴日本以前在国外申请，和赴日本以后在日本申请两类，而基本上是以后者为多；以奖学金的对象来看，大多授予大学以上的学生、研究人员提供的奖学金较多，为专修学校学生或在日语教育机关学习的学生、旁听生、科目等履修生、研究生所设的奖学金很少。
希望得到奖学金的人，一般要通过书面资料审查，及专门领域知识和语言等的笔试，面试审查等考试来决定能否得到奖学金；大多数学生是通过在籍学校提出申请，具体情况可以向有关学校的负责留学生部门询问。
