1、政府奖学金
申请日本政府的奖学金需要通过日本驻外大使馆的推荐，或日本国内大学的推荐。
2、地方自治体奖学金
这是日本地方政府对在该管理区内居住的或在其管辖区内的学校读书的外国留学生提供的奖学金。此项奖学金的支付形式多种多样，其中包括学费、生活费或住宿费的补助、国民健康保险补助、发给交通券以及购书券。申请地方自治体奖学金首先要认真阅读申请资格表，确认有申请资格。申请资格认定后，要到当地政府或你所在的学校索取所需文件表格。填好申请书，搜集所需的资料，如个人履历表、在学证明书、指导教师推荐书、健康证明书、照片、外国人登记证明的复印件等等。然后上交给当地政府或你所在的学校。这以后一般还要进行一次笔试和一次面试。笔试通常包括一般教育课程、专业科目、日语能力等项目的考试;面试通常是根据本人情况以及你在日本与本国的文化交流所作的努力而考虑的。选考的结果将通过当地政府或校方告之本人。
3、民间团体奖学金
民间团体奖学金制度是在企业、财团或个人提供基金基础上创立的。这些奖学金几乎只能在进入日本的大学或研究生院后才能有资格申请，而且，各类奖学金几乎全是通过留学生所在的大学申请的。支付形式也是多种多样的：代付学费、生活费或住宿费的补助、国民健康保险补助、提供交通券、购书券等。
4、各高等院校提供的校内奖学金
此项奖学金是由各个大学设立的奖学基金提供的。目前，在日本，对外国留学生减免学费的大学正在日益增多，所以学生入学前最好了解清楚。
5、外国自费留学生学费减免制度
财团法人日本国际交流协会建立了一项制度：对一些私立大学、专修学校、研究生院的外国自费留学生减免30%的费用。另外，对在研究生院以及大学本科、短期大学、专修学校学习的外国自费留学生中品学兼优，并且经有关部门评定应给予援助者，财团法人日本国际教育协会也会给予奖学金。