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药物化学的起源与发展
(一)发现阶段(discovery)
公元前16世纪——埃伯斯伯比书又称埃伯斯紙草文稿 (Ebers papyrus)，该书里面记述许多用于帮助治疗的咒文和祷文;包含众多的处方和配制方法。其中包括多种植物药：鸦片，大麻，肉桂，芦荟，大蒜等植物药。 是最早记录有关医疗实践的书籍。下面这两个就是改书的原稿。
至少在治疗学及药理学研究体系形成和发展的几千年前，人类就开始使用药物。人们品尝存在于生活环境中的植物(例如中国古代的神农尝百草)，其中产生令人有舒适感的植物或者有明确治疗效果的植物，就被用于作为药物使用。而产生毒性作用的植物则被用来打猎、战争或其他特别用途，但无论是药物还是毒物，都丰富了人类的文化。
(二)发展阶段(development)
19世纪，有机化学工业从无到有发展很快。人们在煤焦油中分离出苯、萘、蒽、甲苯、苯胺等一系列新的化合物。1856年，化学家帕金(W.H.Parkin1838-1907，英)以苯胺为原料合成了苯胺紫—第一个人工合成的染料。以后化学家又合成了一系列染料，发现了药物和香料。 1932年法国的一家研究所在研究含有磺酰氨基团的偶氮染料——百浪多息时
发现其对感染了链球菌的小白鼠有保护作用，由此合成了一系列的磺胺药物。先以为是偶氮(-N=N-)部分起作用，后发现是苯磺酰氨基的作用。进而发现了磺胺嘧啶、磺胺甲恶唑等磺胺类药物。之后，有人提出化学结构与药理的相互关系，该设想是药化发展史上的一大进步;但是药物有效基团论也阻碍了新药创制。分离提纯方法及鉴定手段的进展，使人们认识到药物与机体代谢的关系如体内代谢物(雌、雄激素等)扩展了寻求新药的途径;分离提纯方法及鉴定手段的进展，使人们认识到药物与机体代谢的关系如体内代谢物(雌、雄激素等)扩展了寻求新药的途径;抗生素的发现和发展，半合成抗生素的兴起，抗癌药物的发展等都给药物化学开拓了新的领域;化学合成和生产技术上带来的新方法、新技术、新原料和新试剂，为药化的进一步发展打下了更为丰富的物质基础;近代药物化学以受体、酶等为作用靶点(锁匙关系)开发新药，计算机辅助药物设计。
(三)设计阶段(design)
20世纪60年代至今在这期间，恶性肿瘤、心脑血管疾病和免疫性等疾病的药物研究与开发遇到了困难，按以前的方法与途径研究开发，成效并不令人满意。
物理化学和物理有机化学，生物化学和分子生物化学的发展，精密的分析测试技术如色谱法、放射免疫测定、质谱、核磁共振和X-线结晶学的进步，以及电子计算机的广泛应用，为阐明作用机理和深入解析构效关系准备了坚实的理论和强有力的实验技术，使药物化学的理论与药物设计的方法和技术不断地升华和完善 . 1964年Hansch和藤田以及Free-Wilson同时提出了定量构效关系的研究方法，成为药物化学发展的新的里程碑。
此外，用计算机辅助研究药物在体内的过程，从整体水平上为研究设计新药提供了新的方法和参数，体内微量内源性物质如花生四烯酸及其代谢物，以及受体激动剂和拮抗剂的设计与合成，离子通道的激动剂和阻滞剂的发现，前药原理和软药原理的广泛应用等，都在一定程度上把药物化学提到了新的水平。现代药物化学以分子生物学及计算机科学为支撑，表现出以下特点： 以受体、酶、核酸、离子通道为药物作用的靶点。
药物化学及新药研究中的也遭受了挫折，给予我们惨痛的教训。
二十世纪六十年代，镇静药沙利度胺(Thalidomide，反应停)事件，孕妇服用后，可减轻妊娠呕吐反应。服用后发现，所生婴儿为缺乏上肢，手掌直接连在肩上的畸胎(海豹儿)。
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